통계학습 및 유전통계
그림 2 Acute myeloid leukemia mutations potentially changing TF MYC1 binding [MYC1 전사인자 결합을 변화시킬 가능성이 있는 백혈병 결실 변이]
인공지능 시대에 다양한 기계 학습 접근법과 기술들이 넘쳐나고 있고 이를 이용한 빅데이터 분석은 과학과 사회에 큰 기여를 할 수 있습니다. 저는 통계학자 및 데이터 과학자로서 빅데이터 분석과 통합을 기반으로 새로운 과학적 발견을 이끌어낼 수 있는 통계 방법을 개발합니다. 개발한 기계 학습 기법의 핵심 특징은 빅데이터 분석에 적용시 과학적 가치를 가지며 해석 가능한 결과를 도출한다는 것입니다. 제가 연구하는 통계 학습 및 검정 방법은 빅데이터를 다루며 생명과학 연구 및 경제학을 포함한 다양한 분야에서 해석 가능한 학습을 가능하게 합니다.
방법론을 실행하기 위해 효율적인 알고리즘을 설계하고, 이를 학술 커뮤니티에 배포합니다. 개발된 방법론과 알고리즘에 대한 엄밀한 수리적 이해를 위해, 통계 점근 이론 및 수학적 최적화 이론에 관한 연구를 수행하고 있습니다. 제가 개발한 새로운 계산 및 통계적 방법은 주로 생명과학 및 역학 등의 분야에 흥미로운 추론 및 예측 문제를 해결하는 데 사용됩니다. 제 연구 주제의 일부는 다음과 같습니다:
i. 모수 / 준모수 모델의 변수 선별 및 구조 복원을 위한 정칙화 추정법 개발
ii. 유전체 변이에 의한 DNA - 전사 인자 결합 변화에 대한 확장 가능한 통계적 유의성 검정법 개발
iii. 생물학적 메커니즘의 기반이 되는 유전체적 및 후성 유전체적 특성을 밝히기 위해 오믹스 및 유전체 데이터에 대한 다관점 학습법 개발.
Selected publication
- Federico Abascal, Reyes Acosta, Nicholas J. Addleman et al. (2020). Expanded encyclopaedias of DNA elements in the human and mouse genomes. Nature, 583, 699-710. https://doi.org/10.1038/s41586-020-2493-4
- Federico Abascal, Reyes Acosta, Nicholas J. Addleman et al. (2020). Perspectives on ENCODE. Nature, 583, 693-698. https://doi.org/10.1038/s41586-020-2449-8
- Sunyoung Shin, Yufeng Liu, Stephen R. Cole, & Jason P. Fine. (2020). Ensemble estimation and variable selection with semiparametric regression models. Biometrika, 107(2), 433-448. https://doi.org/10.1093/biomet/asaa012
- Sunyoung Shin, Rebecca Hudson, Christopher Harrison, Mark Craven, & Sunduz Keles. (2019). atSNP Search: a web resource for statistically evaluating influence of human genetic variation on transcription factor binding. Bioinformatics, 35(15), 2657-2659. https://doi.org/10.1093/bioinformatics/bty1010
- Sunyoung Shin, & Sunduz Keles. (2017). Annotation regression for genome-wide association studies with an application to Psychiatric Genomics Consortium data. Statistics in Biosciences, 9(1), 50-72. https://doi.org/10.1007/s12561-016-9154-z
- Sunyoung Shin, Jason P. Fine, & Yufeng Liu. (2016). Adaptive estimation with partially overlapping models. Statistica Sinica, 26(1), 235-253. https://doi.org/10.5705/ss.2014.233
